凍幹曲線以板層溫度為依據，因為產品受板層溫度支配的控製，板層溫度也就控製了產品溫度，設定凍幹機的凍幹曲線需要考慮以下因素：

產品的品種，產品不同則共熔點不同，共熔點的產品要求預凍的溫度低，加熱時板層的溫度也相應低，要根據試驗找出一個產品的冷凍速率，以獲得高質量的產品和較短的冷凍幹燥時間。

時間不同對殘餘水份的要求也不同，要求保存時間不同對殘餘水份的要求也不同，對凍幹時間相應也不同，另外裝量的多少、密器的品種、凍幹機的性能等因素都直接關係到凍幹曲線的製訂，用戶應根據凍幹產品的性質，參照以往的凍幹經驗，設置凍幹曲線。

生物製品的凍幹產品，需要有一定的物理形態、均勻的顏色、合格的殘餘水份含量，良好的溶解性、高效的存活率、較長的保存期，因此不僅要對製作過程和凍幹後的密封保存進行控製，更重要的是要對冷凍幹燥過程的每一階段的各個參數進行全麵的控製，凍幹曲線就是進行冷凍幹燥過程控製的基本依據。所以一些價值高的，對溫控要求高的樣品物料需要選擇合適的帶有凍幹曲線，數據工藝，控溫精度高的冷凍幹燥機。